Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CD164Q04900 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms