Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	EST3	YIL009C-A	546 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YAL037W	YAL037W	804 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RCN1	YKL159C	636 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	SME1	YOR159C	285 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	APM3	YBR288C	1452 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	ATG11	YPR049C	3537 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	NET1	YJL076W	3570 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	CDC55	YGL190C	1581 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	ERT1	YBR239C	1590 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	POM152	YMR129W	4014 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	GPM2	YDL021W	936 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YEA4	YEL004W	1029 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	ARL3	YPL051W	597 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	NTC20	YBR188C	423 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	PDR1	YGL013C	3207 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	PRP8	YHR165C	7242 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	ANR2	YKL047W	1551 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	MAL33	YBR297W	1407 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	SAE2	YGL175C	1038 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	TAD1	YGL243W	1203 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YNL303W	YNL303W	348 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RRG7	YOR305W	729 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RRD2	YPL152W	1077 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RRG8	YPR116W	834 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	GIN4	YDR507C	3429 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	HAA1	YPR008W	2085 nt		3.04	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	KRE2	YDR483W	1329 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YCR013C	YCR013C	648 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RIM1	YCR028C-A	408 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	THG1	YGR024C	714 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RPL11B	YGR085C	525 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	SEC14	YMR079W	915 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	AIM36	YMR157C	768 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YMR187C	YMR187C	1296 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	CSI2	YOL007C	1026 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	YOR050C	YOR050C	348 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	RPL11A	YPR102C	525 nt		3.03	□□□□□ -1.92
SYF1	Q04048	AXL1	YPR122W	3627 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YDR262W	YDR262W	819 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	LOC1	YFR001W	615 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YGL109W	YGL109W	324 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	PCL5	YHR071W	690 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YKL066W	YKL066W	444 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	PSY1	YKL076C	384 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	MST28	YAR033W	705 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	DBP7	YKR024C	2229 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	ATG13	YPR185W	2217 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	CEP3	YMR168C	1827 nt		3.02	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	DBF20	YPR111W	1695 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	LST4	YKL176C	2487 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	STD1	YOR047C	1335 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	UBC13	YDR092W	462 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YDR203W	YDR203W	318 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	KEI1	YDR367W	666 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	PGD1	YGL025C	1194 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	PAI3	YMR174C	207 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YNL050C	YNL050C	813 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YPL119C-A	YPL119C-A	264 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	TAZ1	YPR140W	1146 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	POP7	YBR167C	423 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	SCP160	YJL080C	3669 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	FLO11	YIR019C	4104 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	KAP104	YBR017C	2757 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	RSM28	YDR494W	1086 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	MIC19	YFR011C	513 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YIL012W	YIL012W	342 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	AYR1	YIL124W	894 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	ICY1	YMR195W	384 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	BRX1	YOL077C	876 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	SEC66	YBR171W	621 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	UBP14	YBR058C	2346 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	ESL1	YIL151C	3357 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YGR067C	YGR067C	2415 nt		3	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	SMC6	YLR383W	3345 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	MET6	YER091C	2304 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YDR248C	YDR248C	582 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	CAJ1	YER048C	1176 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YGR226C	YGR226C	210 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	LIN1	YHR156C	1023 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	snR191	snR191	274 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YDR338C	YDR338C	2088 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	FRE2	YKL220C	2136 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	TIM11	YDR322C-A	291 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	ERV1	YGR029W	570 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	Q0144	Q0144	330 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	RPL14B	YHL001W	417 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YIL174W	YIL174W	228 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YJL222W-A	YJL222W-A	228 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	LCL2	YLR104W	396 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	ECI1	YLR284C	843 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	RCE1	YMR274C	948 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	HSP10	YOR020C	321 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	SUS1	YBR111W-A	291 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	AGE1	YDR524C	1449 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	SLH1	YGR271W	5904 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	ESC2	YDR363W	1371 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	YLR108C	YLR108C	1458 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	SLF1	YDR515W	1344 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	Q04048	RSN1	YMR266W	2862 nt		2.97	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.2 ms