Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms