Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC25A11Q02978 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms