Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOP2BQ02880 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms