Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF17Q02223 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF17Q02223 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms