Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms