Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms