Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms