Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms