Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFAMQ00059 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms