Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKOR1P84550 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms