Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTRA4P83105 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms