Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL8P80075 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL8P80075 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL8P80075 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL8P80075 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL8P80075 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL8P80075 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL8P80075 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL8P80075 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL8P80075 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL8P80075 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL8P80075 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL8P80075 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms