Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HBBP68871 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HBBP68871 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HBBP68871 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HBBP68871 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms