Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms