Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VBP1P61758 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VBP1P61758 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VBP1P61758 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VBP1P61758 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VBP1P61758 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VBP1P61758 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VBP1P61758 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms