Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FBXW4P57775 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms