Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUP107P57740 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NUP107P57740 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NUP107P57740 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NUP107P57740 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP107P57740 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP107P57740 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NUP107P57740 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms