Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCBP4P57723 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms