Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BACE1P56817 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BACE1P56817 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BACE1P56817 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BACE1P56817 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BACE1P56817 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BACE1P56817 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms