Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms