Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FCGRTP55899 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FCGRTP55899 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms