Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL23P55773 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL23P55773 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL23P55773 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL23P55773 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms