Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP7P55210 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP7P55210 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP7P55210 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP7P55210 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP7P55210 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP7P55210 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP7P55210 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP7P55210 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP7P55210 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CASP7P55210 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP7P55210 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP7P55210 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP7P55210 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP7P55210 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP7P55210 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP7P55210 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP7P55210 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP7P55210 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP7P55210 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms