Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPAP53621 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPAP53621 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPAP53621 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPAP53621 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPAP53621 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPAP53621 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPAP53621 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COPAP53621 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COPAP53621 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPAP53621 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPAP53621 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPAP53621 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPAP53621 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPAP53621 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPAP53621 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms