Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACLYP53396 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACLYP53396 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACLYP53396 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACLYP53396 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACLYP53396 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACLYP53396 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms