Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK4P51957 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK4P51957 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK4P51957 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK4P51957 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK4P51957 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK4P51957 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK4P51957 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK4P51957 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK4P51957 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK4P51957 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK4P51957 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK4P51957 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms