Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP5P51878 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP5P51878 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP5P51878 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP5P51878 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP5P51878 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP5P51878 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP5P51878 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP5P51878 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP5P51878 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP5P51878 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP5P51878 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP5P51878 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP5P51878 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP5P51878 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP5P51878 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms