Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCNKBP51801 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms