Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN6P51797 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN6P51797 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms