Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RORCP51449 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RORCP51449 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RORCP51449 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RORCP51449 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RORCP51449 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RORCP51449 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RORCP51449 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RORCP51449 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RORCP51449 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RORCP51449 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RORCP51449 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RORCP51449 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms