Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLK1P49759 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLK1P49759 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLK1P49759 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLK1P49759 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLK1P49759 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLK1P49759 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLK1P49759 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLK1P49759 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLK1P49759 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLK1P49759 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLK1P49759 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLK1P49759 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLK1P49759 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLK1P49759 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLK1P49759 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms