Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRIM1P49642 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms