Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNTAP49354 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNTAP49354 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms