Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPIAP49247 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPIAP49247 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPIAP49247 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPIAP49247 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPIAP49247 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RPIAP49247 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPIAP49247 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPIAP49247 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPIAP49247 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPIAP49247 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPIAP49247 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPIAP49247 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPIAP49247 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPIAP49247 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPIAP49247 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPIAP49247 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms