Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITPNBP48739 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms