Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTRNP46939 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTRNP46939 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTRNP46939 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTRNP46939 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTRNP46939 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTRNP46939 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTRNP46939 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTRNP46939 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTRNP46939 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTRNP46939 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTRNP46939 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTRNP46939 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTRNP46939 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTRNP46939 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms