Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS9P46781 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS9P46781 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS9P46781 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS9P46781 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS9P46781 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS9P46781 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS9P46781 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS9P46781 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms