Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms