Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGEA1P43355 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms