Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR1P43307 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR1P43307 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR1P43307 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR1P43307 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR1P43307 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSR1P43307 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSR1P43307 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSR1P43307 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSR1P43307 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR1P43307 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms