Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNPLA4P41247 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNPLA4P41247 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms