Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRLP40313 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTRLP40313 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CTRLP40313 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms