Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FDFT1P37268 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms