Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJC1P36383 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJC1P36383 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJC1P36383 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJC1P36383 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJC1P36383 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJC1P36383 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJC1P36383 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms