Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYLC1P35663 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms