Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
THBS4P35443 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
THBS4P35443 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
THBS4P35443 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
THBS4P35443 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
THBS4P35443 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
THBS4P35443 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
THBS4P35443 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms