Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.16e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-208ENST00000537745 1065 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.446e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-207ENST00000536606 572 ntTSL 311.84□□□□□ -0.516e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-204ENST00000464211 562 ntTSL 510.8□□□□□ -0.686e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.826e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.946e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-203ENST00000448750 2455 ntTSL 28.18□□□□□ -1.16e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RAN-206ENST00000535090 657 ntTSL 55.78□□□□□ -1.486e-14■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.794e-11■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RIC8A-216ENST00000532373 620 ntTSL 318.25■□□□□ 0.514e-11■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RIC8A-210ENST00000528357 500 ntTSL 417.29■□□□□ 0.364e-11■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.34e-11■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RIC8A-205ENST00000526982 965 ntTSL 315.97■□□□□ 0.154e-11■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.044e-11■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 RIC8A-213ENST00000530889 563 ntTSL 214.46□□□□□ -0.094e-11■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.22e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 MBOAT7-204ENST00000414665 876 ntTSL 222.58■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 MBOAT7-208ENST00000453320 557 ntTSL 413.94□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 30.3
GTF2F1P35269 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 C7orf49-206ENST00000472428 723 ntTSL 213.03□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 C7orf49-207ENST00000477820 531 ntTSL 313.03□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 C7orf49-204ENST00000459937 2576 ntTSL 1 (best)9.69□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.673e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 423.7■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 323.7■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 221.2■□□□□ 0.983e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 519.37■□□□□ 0.693e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.683e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 218.75■□□□□ 0.593e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 214.67□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1P35269 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 INPPL1-209ENST00000540973 375 ntTSL 328.19■■■□□ 2.11e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 INPPL1-214ENST00000543234 275 ntTSL 223.79■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.473e-8■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.983e-8■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 ARHGEF10L-208ENST00000482892 539 ntTSL 311.77□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 ZNF580-206ENST00000592881 1019 ntTSL 323.79■■□□□ 1.48e-7■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 319.67■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 317.39■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)21.54■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 218.27■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 314.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.39e-8■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.229e-8■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.379e-8■■■■■ 30.1
GTF2F1P35269 AXIN2-206ENST00000580513 1060 ntTSL 227.5■■□□□ 1.996e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 AXIN2-207ENST00000585045 1034 ntTSL 222.83■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 AXIN2-204ENST00000577278 976 ntTSL 518.93■□□□□ 0.626e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 AXIN2-203ENST00000544103 621 ntTSL 318.04■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.243e-8■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MAD1L1-211ENST00000445959 831 ntTSL 320.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 30
GTF2F1P35269 HDAC7-227ENST00000548080 1479 ntTSL 518.74■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NR1H2-208ENST00000597157 856 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.439e-14■■■■■ 30
GTF2F1P35269 HDAC7-224ENST00000488927 739 ntTSL 517.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MAD1L1-208ENST00000437877 864 ntTSL 216.24■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MAD1L1-206ENST00000429625 750 ntTSL 516.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 30
GTF2F1P35269 SOGA1-203ENST00000463491 802 ntTSL 216.09■□□□□ 0.179e-14■■■■■ 30
GTF2F1P35269 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 510.9□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 30
GTF2F1P35269 UHRF1-202ENST00000613817 1859 ntTSL 222.96■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 30
GTF2F1P35269 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 30
GTF2F1P35269 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 30
GTF2F1P35269 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 30
GTF2F1P35269 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-210ENST00000432052 598 ntTSL 423.07■■□□□ 1.284e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-225ENST00000477824 571 ntTSL 523.06■■□□□ 1.284e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-215ENST00000444094 551 ntTSL 421.7■■□□□ 1.064e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-227ENST00000486656 577 ntTSL 420.57■□□□□ 0.884e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 320.57■□□□□ 0.884e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 318.87■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 516.95■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-213ENST00000438962 573 ntTSL 416.04■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NPC1L1-202ENST00000381160 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 VAV2-204ENST00000472905 506 ntTSL 318.31■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 526.58■■□□□ 1.851e-8■■■■■ 30
GTF2F1P35269 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 414.86□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 30
GTF2F1P35269 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 29.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 145.8 ms