Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCVRNP35243 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RCVRNP35243 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms